乙型肝炎病毒过去被称之为嗜肝病毒，实际上到了慢性活动性肝炎阶段，全身很多脏器都会受到影响，只是轻重有所不同。
（1）血液系统血小板减少最为常见，其次是白细胞、红细胞和血红蛋白下降，严重者表现为再生障碍性贫血、单核细胞缺乏症、溶血性贫血、镰状红细胞性贫血等等。发病与免疫复合物沉着在造血器官--骨髓及病毒在接侵犯有关，另外也和肝脏病变后供给骨髓的营养物质缺乏有关。
（2）皮肤顽固性等麻疹及其他各种类型的皮炎、皮肌炎等。
（3）肾脏乙肝相关性肾炎有慢性肾小球肾炎、肾病综合征的表现。而顽固性蛋白尿分为膜性肾炎与膜性增殖性肾炎，这与乙肝病毒对肾脏的侵犯及抗原抗体免疫复合物沉着有关。
（4）血管可出现血管神经性水肿。
（5）结节性多动脉炎可出现关节疼痛。
(6）胰腺出现慢性胰腺炎，个别患者有癌变。
(7）心脏可出现心脏扩大、早搏、心动过缓、低血压等。
（8）神经系统可出现多发性神经炎，重型肝炎可发生无菌性脑膜炎。
（9）胃肠道可出现轻度肥厚性（增生性）胃炎。
（10）生殖系统可致子宫颈细胞异常。部分患者可引起癌变。
