病人在医院经常需要做肝功能检查，如病人住院前需要检查肝功及乙肝表面抗原，各种手术前需要检查肝功及乙肝表面抗原，此外，做气管镜、胃镜、腹腔镜、结肠镜、十二指肠引流等，检查前都需要检验肝功及乙肝表面抗原。这主要是为了做好消毒隔离工作。例如，胃镜是个高级医疗器械，又不太好彻底消毒，如果检查前不查肝功及乙肝表面抗原，可造成人为的相应交叉感染。如果检查肝功异常，可暂停做胃镜，待肝功能恢复正常后再做；若发现是乙肝表面抗原阳性，可改用固定式胃镜做，这样便于消毒。
另外，有些药物对肝脏有损害。可在服药前及眼药后定时查肝功，以观察药物的毒性反应，以便及时停药或换其他药物。当然，任何怀疑肝脏有疾患的病人，一般都要检查肝功能。
