梅毒血清学试验对梅毒的诊断有很大的价值，但它存在着一定的假阳性和假阴性情况，其结果一定要结合病史和临床、体格检查综合分析考虑。
什么情况下会引起假阳性呢?某些疾病中由于感染或免疫紊乱等会使机体产生与梅毒相交叉的抗体反应，造成生物性假阳性，如疟疾、麻风、系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、结节性多动脉炎、肝硬化。可能发生急性BFP反应的感染性疾病有风疹、上呼吸道感染、病毒性肺炎等等。对于阳性结果不能以此认定梅毒。而需进一步分析，除病史和临床之外，应分析如为非特异性试验阳性，必须明确其非特异性试验的滴度(定量试验结果)高低，在RPR滴度在1：8以下，应作确认试验，即特异性梅毒检测，如荧光梅毒螺旋体抗体或TPDA试验。
还有不少患者拿着RPR阳性检查报告单，到处求诊，检查报告单"仅写着RPR或USR阳性"，有的以"十"表示，这样会给临床医生带来误解，每次检查应当对阳性的结果报告准确的滴度(即定量的结果)，这样就便于临床治疗后的疗效观察，梅毒经正规治疗后，非特异性抗体是呈逐步下降的，完全转阴性需半年或一年，有的长达二年。有的患者因RPR阳性，在复诊时每次都重复正规疗程治疗，这就造成患者的痛苦。
梅毒经治愈后，随之血清非特异性试验转阴，但仍需定期作血清复查以防复发。但患了梅毒特异性试验一般保持终身阳性，不需再治疗。
