HIV感染者由于免疫缺陷，最终都会发生机会性感染，严重时可危及生命。据尸检分析，90%以上的艾滋病患者死于机会性感染。因此，HIV本身目前虽然尚无彻底治愈药物，但如能治疗机会性感染同样可以延长其生命，降低病死率，改善生活质量。
1.抗原虫疗法
（1）卡氏肺囊虫肺炎（PCP）：
a.复方新诺明，每片含TMP 100mg、SMZ 400mg，口服2片，6小时1次，服7天;2片,8小时1次，服14天;2片每天2次，服7-14天。为预防复发，可用乙胺嘧啶10周效磺胺混合制剂（Fansidar），每周服1片，有效率60%-80%，其中半数有不良反应，如皮疹、发热、血细胞及血小板下降、GPT升高等闲中逆性副作用。
b .羟乙磺酸戊烷咪，主要作用机理可能是抑制DNA和叶酸的合成。对复方新诺明不能耐受者，可换用本药结束疗程。一般用200mg肌内注射，每天1次，连用14天，或衡释静滴，每日1次，连用14天症病从事贸易，可用600mg溶于6ml无菌水中，雾化吸入20-30分钟（估计吸入量为300 mg），每天1次，连用21天。
c.二氟甲基鸟氨酸（flornithine），是鸟氨酸脱羧酶的不可逆制剂，静注每日400 mg/ kg，2周后口服每日300mg/ kg，服2-6周，有效率33%-72%不等。主要副作用为骨髓抑制、血细胞减少、胃肠功能紊乱、肝炎和听力障碍。
e.克林达霉素（Clindamycin）和伯氨喹宁联合治疗，克林达霉素900 mg衡释静脉滴注8小时1次，滴注10天，以后口服450 mg6小时1次，服11；同期给予伯氨喹宁26.4 mg（2片）口服，每日1次，连服21天。
（2）弓形体病：乙胺嘧啶，首日75 mg，以后12.5-25 mg /次，口服2次，连服3天后改为12.5mg，每日1-2次，连用1月夺邪之嘧啶，每日100 -200mg/kg，分4次口服，疗程为2-3周。副作用有药疹、发热及骨髓抑制引起的周围血细胞减少，可服叶酸5 mg，2次/日，连服1-2月，加以预防。亦可用乙胺嘧啶加复方新诺明或加氯林可霉素联合治疗。对一般情况差者，可短程加用小剂量地塞米松，以减轻副反应，降低病死率。
（3）隐孢子虫肠炎：可用螺旋霉素1克，每天3-4次，口服，3-6周为1疗程。可使症状减轻，但不能清除虫体。亦可用灭滴灵和氯林可霉素治疗。
2．抗霉菌疗法
（1）隐球菌感染：首选氟康唑（fluconazole），成人首次剂量400mg，以后200-400mg/日，分2次服。疗程长短视病情而定。治疗隐球菌性脑膜炎，以静脉给药为妥，剂量同上，疗程至少6周。副反应发生率为10%，其中半数为轻度胃肠道反应，其次为皮疹、头痛、失眠、头晕等。
（2）白色念珠菌感染：口部感染，可用制霉菌素和甘油或蜂蜜的混悬液局部涂擦。如食道有念珠菌感染，可口服制霉菌素的混悬液。目前白色念珠菌感染常用酮康唑，200-400mg/次，每日服1-2次。主要毒副作用为肝毒性、胃肠道反应及皮疹等。难治性白色念珠菌感染，可经静脉途径使用二性霉素B。
其他抗真菌药，如伊曲康唑（Itraconazole）、益康唑（Fconazole）、克霉唑（Clotrimazole）和5-氟胞嘧啶（5- Floorcytosine）等亦可酌情选用。
3.抗病毒治疗
（1）细胞病毒（CMV）、单纯疱疹病毒（HSV）、EBV、带状疱疹病毒（HZV）等感染：除引起皮肤粘膜和生死嚣疱疹外，还可引起严重的全身散性感染。可用无环鸟苷，400-600mg/次，每日3-4次，口服2-3周为1疗程。亦可用丙氧鸟苷，每日5 mg /kg ，每8小时静脉点滴1小次，2-4周为1疗程。该药主要用于CMV的严重感染，其副作用有可逆性的中性粒细胞减少。必要时，用以上药物的同时，联合使用重组干扰素。
（2）肝炎病毒感染：HCV或HBV感染，可用干扰素治疗。对早期丙肝，有效率为30%-40%。
4.结构杆菌感染的治疗
艾滋病上起播散性感染，治疗很困难，可以联合使用利福平、乙胺丁醇、异烟肼和链霉素等治疗。推荐治疗剂量同重型结核病：利福平，600-900mg/日，口服；乙胺丁醇，250-500 mg/次，每欠，口服烟肼，300-600 mg /日，口服。疗程6-12个月甚至2年。如肝功正常，口才有中枢神经系统感染、播散性感染或疑有异烟肼耐药时，可加用吡嗪酰胺，每次500mg，每日3次口服，该药一般只在治疗开始的2个月中应用。
