从现有的乙 肝病毒检测指标看，需要转阴的乙 肝病毒指标是乙 肝三系统中的3项抗原，即乙 肝病毒表面抗原、e抗原、核心抗原，以及乙 肝病毒脱氧核糖核酸。如果这些乙 肝病毒标记物统统消失，则可以认为乙 肝获得彻底治愈。由于外周血液中没有游离的乙 肝病毒核心抗原，所以抽血检查尚无法了解到乙 肝病毒核心抗原的情况，这给正确判断乙 肝病毒转阴治疗带来了不少麻烦和困难。现在依靠乙 肝病毒核心抗体的检测来侧面推断乙 肝病毒核心抗原的情况。如果实验室检查结果为乙 肝病毒表面抗原、e抗原、核心抗体同时阳性，一般此时乙 肝病毒脱氧核糖核酸也会阳性，表示病毒处于复制状态，传染性强，是进行抗病毒治疗（转阴治疗）的时机。如果经过治疗，乙 肝病毒e抗原、脱氧核糖核酸获得阴转，则可认为抗病毒治疗疗效显著；如果其中一项阴转，说明有效，仍要继续抗病毒治疗，直到两面项病毒复制指标都阴转为止。如果患者检查结果为乙 肝病毒表面抗原、e抗体、核心抗体为阳性，同时乙 肝病毒脱氧核糖核酸亦为阳性，依然认为病毒处于复制状态，有传染性，也需进行抗病毒治疗，直到乙 肝病毒脱氧核糖核酸阴转为止。如果乙 肝病毒指标仅为表面抗原阳性，e抗原及脱氧核糖核酸为阴性，则不属于抗病毒治疗（转阴治疗）的范畴。
总而言之，目前乙肝病毒的转阴治疗只是针对乙 肝病毒e抗原、脱氧核糖核酸这两项指标而方，对于乙 肝病毒表面抗原尚无任何有效药物治疗。
目前，各种抗病毒药物只能抑制乙 肝病毒复制、缓解肝脏的炎症活动，对于整合的乙 肝病毒复制无作用，对于肝细胞核内乙 肝病毒的超螺旋共价闭合环形脱氧核糖核酸（cccDNA）也无作用，故停药后超螺旋共价闭合环形脱氧核糖核酸可能再次恢复到用药前的水平。抗病毒药物联合免疫调节治疗可以减轻不良反应，增强抗病毒效果，但总体疗效仍未有根本性改善。新的抗病毒治疗方法，如基因疗法、疫苗疗法、导向疗法仍处于实验研究阶段，尚未获得认可。因此，目前尚不存在能使乙 肝病毒永久阴转的药物和疗法。
