应用聚合酶链反应技术或斑点杂交技术检测乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸，是近几年研究提出的，并在临床逐渐推广使用的乙型肝炎病毒检测指标，临床意义十分重要。它和乙型肝炎病毒三系统检测（俗称"两对半"）相互配合、相互弥补，成为乙型肝炎病毒检测、诊断乙型肝炎的"黄金搭档"。
检测乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸的临床意义有以下几点：
（1）发现和鉴定非典型的乙型肝炎病例：以往诊断乙型肝炎主要靠测定乙型肝炎病毒表面抗原或"两对半"，如果乙型肝炎病毒表面抗原为阳性，才可确诊。现在看来这种确诊方法有一定缺陷，它可能使多种非典型的乙型肝炎漏诊。而乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸检测犹如一把"魔镜"，可以识别出各种古怪的乙型肝炎。
（2）准确判断乙型肝炎病毒阴转的结果：以往认为乙型肝炎"大三阳"转为"小三阳"是病情好转、传染性降低的标志，现在发现并非完全如此，一部分转阴可能是病情好转的标志，另一部分可能预示着病情恶化的开始。好转者一般检查乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸始终为阴性，肝功能完全正常；恶化者乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸始终为阳性，肝功能反复异常。因此，乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸检测的结果至关重要。
（3）评定乙型肝炎病毒携带者的实际状况：病毒携带者检查结果为乙型肝炎病毒e抗原和乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸同为阴性，预后良好，这种情况一般不用药物治疗；乙型肝炎病毒携带者长期乙型肝炎病毒e抗原和乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸阳性，预后较差，这种情况一般需要用药物治疗或干预。
（4）保证血源的安全性：现在献血者排除乙型肝炎的检测方法是乙型肝炎病毒表面抗原阴性、肝功能正常，这显然不够，这样做，可能会使一部分乙型肝炎病毒表面抗原阴性的乙型肝炎患者成为献血者。所以，只有乙型肝炎病毒表面抗原和乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸同为阴性者，方能排除乙型肝炎。
（5）判断乙型肝炎患者传染性的大小：不管乙型肝炎病毒"两对半"检查结果如何，只要乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸检测为阳性，即可说明此时乙型肝炎的传染性强。
（6）评价治疗乙型肝炎药物的疗效：考察某种药物治疗乙型肝炎是否有效，首先要观察该药对乙型肝炎病毒复制的抑制作用如何。直接反映这一结果的指标就是乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸，其属性和数值的变化，直接反映了疗效的好坏。
（7）调查对乙型肝炎疫苗无反应的原因：有一部分"正常人"，反复注射乙型肝炎疫苗，表面抗体始终不见产生，此时检查乙型肝炎病毒脱氧核粮核酸，很可能发现其结果为阳性或弱阳性，提示这些"正常人"很有可能早已是"隐性感染者"了，此时注射疫苗，已经起不到任何预防作用。
