乙肝抗病毒治疗的目的是最大程度地抑制或清除乙肝病毒，减轻炎症，减少纤维化，让病人活得长一点、好一点，显著减少肝硬化、肝癌的发生。目前可用于抗病毒治疗的药物有干扰素和核苷类药物两大类。如果病人比较年轻，转氨酶水平比较高，e抗原阳性，DNA水平比较低，希望抗病毒治疗能在短期结束（如希望生孩子的育龄妇女），可以选择常规干扰素或聚乙二醇干扰素治疗。
而核苷类药物，如拉米夫定、阿德福韦酯、恩替卡韦、替比夫定等，因为是口服药，服用方便，安全性高，且抗病毒的效果非常明显，因此，美国、欧洲、亚太包括我国的慢性乙肝治疗指南都把它们列为一线药物。
使用核苷类药物抗病毒是一个长期的过程，随着治疗时间的延长，耐药问题就会随之出现。目前使用的核苷类药物都存在一定程度的耐药问题，只是出现的早晚、耐药比率的高低问题。不过，在耐药方面，恩替卡韦有独特的优势。特别是从来未接受过核苷类药物治疗的患者，即使是使用恩替卡韦1―4年，耐药比率也是非常低的。
如何应对恼人的耐药问题呢？
抗病毒耐药的临床处理分三个层次：预防、预测和处理。预防很重要，坚决反对给表面抗原携带者和乙肝病毒携带者滥用抗病毒药物，特别是年轻的病人。因为滥用该药后，非但不能达到预期的目的，而且会产生非常严重的耐药问题，这在临床上是有过教训的。
第二个层次是耐药的预测问题，心中有数对管理病人很有帮助。病毒载量比较高的病人，以前用过口服抗病毒药物治疗的病人，有肝硬化基础的病人，转氨酶水平不是很高的病人，都提示将来有可能耐药。另外，临床工作中发现，男性患者和较胖的患者，耐药比率也高。
由于拉米夫定上市比较早，全国大概超过120万慢性乙肝患者曾经用过拉米夫定，所以其耐药后的处置最受关注。拉米夫定出现耐药后，第一个办法是加用阿德福韦酯，第二个办法是改用两片恩替卡韦，第三是换用干扰素。
