淋病的主要表现是尿道炎和宫颈炎，其次是前列腺炎、附睾炎、盆腔炎等，也可引起眼、咽部、直肠的感染。急性尿道炎的症状是尿道口红肿、痒、刺痛，有脓液流出，然后出现尿频、尿急、尿痛、排尿困难等尿道刺激症状明显，多见于男性，潜伏期常为3～5天。急性症状约一周后可逐渐减轻，如果急性期治疗不当，或由于酗酒及性交等因素可使淋病变成慢性，症状较轻微，感到尿道灼热、微痒、尿痛，晨起排尿时尿道口有少许黏性液或脓液。女性患者主要表现为宫颈炎，其症状是白带增多、阴道口有脓性分泌物排出，外阴瘙痒、阴道内轻微疼痛和烧灼感等，部分患者无任何症状。
淋菌性尿道炎需与非淋菌性尿道炎鉴别，后者主要由衣原体及支原体感染引起，潜伏期常为7～21天，尿道分泌物较少且稀薄，症状轻微。女性淋菌性宫颈炎需与念珠菌性阴道炎、滴虫性阴道炎以及细菌性阴道炎相鉴别。
