目前还没有特效药物，也没有疫苗预防接种。临床上可分为针对艾滋病病毒的治疗，和针对条件致病菌的治疗。
(1)一般疗法对HIV感染者可不予治疗，应列入疾病控制网，严密监视，以防传染他人或转变为艾滋病患者。对艾滋病的相关综合征患者及艾滋病患者，要给予道义上的关心和帮助，让患者注意饮食和休息，创造较好的生存环境；对于长期发热的患者，给予物理降温，对于烦躁、恐惧的患者适当给予镇静剂。
(2)免疫增强疗法如白介素-2，γ-干扰素等有一定的疗效，但效果不大。近年来艾滋病患者有进行骨髓移植者，但只能达到免疫状况暂时性改善。
(3)治疗条件致病菌感染根据不同的病原选择相应的药物：如治疗卡氏肺囊虫性肺炎，可选用复方新诺明(SMZCO)每日20～100mg/kg，分4次服用；也可用羟乙基磺酸戊双脒(Pentamidineisethionate）每日4m g/kg，肌注或静脉点滴。此二药亦可合并应用，疗程为2～3周。
(4)抗HIV的药物治疗叠氮胸苷（AZT）及叠氮去氧胸苷（ZDU）为胸苷核苷的变型，经临床试用似能延长艾滋病病人的生命，实验研究能抑制逆转录酶，阻断HIV的复制，但不能根除病毒，且价格昂贵，药品供应有限，副作用有待进一步研究。
